RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329078.7

SPNS2-201, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS2, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-201ENST00000329078 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SPNS2-201ENST00000329078 AK9Q5TCS8 1911 aa24.2■■□□□ 1.47
SPNS2-201ENST00000329078 MED14O60244 1454 aa24.2■■□□□ 1.46
SPNS2-201ENST00000329078 MX1P20591 662 aa24.2■■□□□ 1.46
SPNS2-201ENST00000329078 PLCB2Q00722 1185 aa24.2■■□□□ 1.46
SPNS2-201ENST00000329078 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
SPNS2-201ENST00000329078 PTPRCP08575 1304 aa24.2■■□□□ 1.46
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
SPNS2-201ENST00000329078 PIK3R4Q99570 1358 aa24.19■■□□□ 1.46
SPNS2-201ENST00000329078 MCCP23508 829 aa24.19■■□□□ 1.46
SPNS2-201ENST00000329078 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
SPNS2-201ENST00000329078 SRGAP3O43295 1099 aa24.18■■□□□ 1.46
SPNS2-201ENST00000329078 NUCB2P80303 420 aa24.18■■□□□ 1.46
SPNS2-201ENST00000329078 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.18■■□□□ 1.46
SPNS2-201ENST00000329078 UNC5CLQ8IV45 518 aa24.18■■□□□ 1.46
SPNS2-201ENST00000329078 PALD1Q9ULE6 856 aa24.18■■□□□ 1.46
SPNS2-201ENST00000329078 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.18■■□□□ 1.46
SPNS2-201ENST00000329078 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
SPNS2-201ENST00000329078 ZSCAN30Q86W11 494 aa24.17■■□□□ 1.46
SPNS2-201ENST00000329078 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SPNS2-201ENST00000329078 PTMAP06454 111 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
SPNS2-201ENST00000329078 KCNA6P17658 529 aa24.17■■□□□ 1.46
SPNS2-201ENST00000329078 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
SPNS2-201ENST00000329078 TEFQ10587 303 aa24.16■■□□□ 1.46
SPNS2-201ENST00000329078 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.16■■□□□ 1.46
SPNS2-201ENST00000329078 GNAI3P08754 354 aa24.16■■□□□ 1.46
SPNS2-201ENST00000329078 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
SPNS2-201ENST00000329078 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.16■■□□□ 1.46
SPNS2-201ENST00000329078 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.16■■□□□ 1.46
SPNS2-201ENST00000329078 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SPNS2-201ENST00000329078 IL17REQ8NFR9 667 aa24.16■■□□□ 1.46
SPNS2-201ENST00000329078 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SPNS2-201ENST00000329078 PSME1Q06323 249 aa24.15■■□□□ 1.46
SPNS2-201ENST00000329078 KCNQ3O43525 872 aa24.15■■□□□ 1.46
SPNS2-201ENST00000329078 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SPNS2-201ENST00000329078 LGR6Q9HBX8 967 aa24.15■■□□□ 1.46
SPNS2-201ENST00000329078 SYCE3A1L190 88 aa24.14■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 TMX3Q96JJ7 454 aa24.14■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC173Q0VFZ6 552 aa24.13■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa24.13■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 RICTORQ6R327 1708 aa24.13■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 TPM2P07951 284 aa24.13■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 KCNJ4P48050 445 aa24.13■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 SPG7Q9UQ90 795 aa24.12■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.12■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 CPA1P15085 419 aa24.12■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.12■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.12■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 UQCRHLA0A096LP55 91 aa24.11■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 UQCRHP07919 91 aa24.11■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 DDIT3P35638 169 aa24.11■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 PDCL3Q9H2J4 239 aa24.11■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 HOXC9P31274 260 aa24.11■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 TSC1Q92574 1164 aa24.11■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.11■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 CHMP3Q9Y3E7 222 aa24.1■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 FGD1P98174 961 aa24.1■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 FAM177BA6PVY3 158 aa24.1■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa24.1■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa24.1■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 FLT4P35916 1363 aa24.09■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 SIL1Q9H173 461 aa24.09■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 RBSNQ9H1K0 784 aa24.09■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa24.08■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 USP6P35125 1406 aa24.08■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 ATP10DQ9P241 1426 aa24.08■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
SPNS2-201ENST00000329078 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.08■■□□□ 1.44
SPNS2-201ENST00000329078 KLHL40Q2TBA0 621 aa24.07■■□□□ 1.44
SPNS2-201ENST00000329078 USP44Q9H0E7 712 aa24.07■■□□□ 1.44
SPNS2-201ENST00000329078 TAOK2Q9UL54 1235 aa24.07■■□□□ 1.44
SPNS2-201ENST00000329078 ATP8B2P98198 1209 aa24.06■■□□□ 1.44
SPNS2-201ENST00000329078 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
SPNS2-201ENST00000329078 CHMLP26374 656 aa24.06■■□□□ 1.44
SPNS2-201ENST00000329078 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
SPNS2-201ENST00000329078 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
SPNS2-201ENST00000329078 IL25Q9H293 177 aa24.04■■□□□ 1.44
SPNS2-201ENST00000329078 LMBRD1Q9NUN5 540 aa24.04■■□□□ 1.44
SPNS2-201ENST00000329078 BTBD11A6QL63 1104 aa24.04■■□□□ 1.44
SPNS2-201ENST00000329078 PTMSP20962 102 aa24.04■■□□□ 1.44
SPNS2-201ENST00000329078 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.03■■□□□ 1.44
SPNS2-201ENST00000329078 NBPF4Q96M43 638 aa24.03■■□□□ 1.44
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SPNS2-201ENST00000329078 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SPNS2-201ENST00000329078 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SPNS2-201ENST00000329078 KIAA0232Q92628 1395 aa24.03■■□□□ 1.44
SPNS2-201ENST00000329078 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.02■■□□□ 1.44
SPNS2-201ENST00000329078 OFD1O75665 1012 aa24.02■■□□□ 1.44
SPNS2-201ENST00000329078 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
SPNS2-201ENST00000329078 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
SPNS2-201ENST00000329078 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.01■■□□□ 1.43
SPNS2-201ENST00000329078 MYL6BP14649 208 aa24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 158.6 ms