RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264694.12

SNX25-201, Transcript of sorting nexin 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SNX25, Length 3,264 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX25-201ENST00000264694 MCM2P49736 904 aa16.05■□□□□ 0.16
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SNX25-201ENST00000264694 KCNF1Q9H3M0 494 aa15.95■□□□□ 0.14
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SNX25-201ENST00000264694 AK2P54819 239 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX25-201ENST00000264694 UBE2HP62256 183 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX25-201ENST00000264694 PDCL2Q8N4E4 241 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX25-201ENST00000264694 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SNX25-201ENST00000264694 ALKQ9UM73 1620 aa15.94■□□□□ 0.14
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SNX25-201ENST00000264694 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
SNX25-201ENST00000264694 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SNX25-201ENST00000264694 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.147e-6■□□□□ 11.2
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SNX25-201ENST00000264694 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX25-201ENST00000264694 TXNDC2Q86VQ3 553 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX25-201ENST00000264694 CPS1P31327 1500 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX25-201ENST00000264694 NUTM2FA1L443 756 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX25-201ENST00000264694 RASEFQ8IZ41 740 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX25-201ENST00000264694 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SNX25-201ENST00000264694 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SNX25-201ENST00000264694 SMC3Q9UQE7 1217 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX25-201ENST00000264694 AATKQ6ZMQ8 1374 aa15.92■□□□□ 0.14
SNX25-201ENST00000264694 TMEM87AQ8NBN3 555 aa15.92■□□□□ 0.14
SNX25-201ENST00000264694 LARGE1O95461 756 aa15.92■□□□□ 0.14
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