RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dusp27Q148W8 1138 aa28.59■■■□□ 2.17
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Col23a1Q8K4G2 532 aa28.58■■■□□ 2.17
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Col11a2Q64739 1736 aa28.52■■■□□ 2.16
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa28.51■■■□□ 2.15
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Atxn3Q9CVD2 355 aa28.38■■■□□ 2.13
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa28.29■■■□□ 2.12
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ksr2Q3UVC0 959 aa28.21■■■□□ 2.11
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cyp2c67Q569X9 491 aa28.21■■■□□ 2.11
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Atp1b3P97370 278 aa28.2■■■□□ 2.1
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zbtb1Q91VL9 713 aa28.2■■■□□ 2.1
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Irx6Q9ER75 438 aa28.2■■■□□ 2.1
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tgfb2P27090 414 aa28.18■■■□□ 2.1
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Eif4a1P60843 406 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Taf1dQ9D4V4 322 aa28.18■■■□□ 2.1
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