RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000034452.11

Ccsap-201, Transcript of Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccsap, Length 2,390 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Dhx16G3X8X0 1044 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
Ccsap-201ENSMUST00000034452 PogkQ80TC5 607 aa27.61■■■□□ 2.01
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Hoxa7P02830 229 aa27.6■■■□□ 2.01
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Pknox2Q8BG99 474 aa27.6■■■□□ 2.01
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Nlgn1Q99K10 843 aa27.6■■■□□ 2.01
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ptpn23Q6PB44 1692 aa27.6■■■□□ 2.01
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Anapc15P60007 132 aa27.6■■■□□ 2.01
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cabp4Q8VHC5 271 aa27.6■■■□□ 2.01
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Map2P20357 1828 aa27.6■■■□□ 2.01
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm45015A0A140LII9 184 aa27.59■■■□□ 2.01
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm18336A0A140LIU8 765 aa27.59■■■□□ 2.01
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Noc3lQ8VI84 807 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Arap3Q8R5G7 1538 aa27.59■■■□□ 2.01
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Atp6v1dP57746 247 aa27.58■■■□□ 2.01
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Mcmdc2E9Q956 681 aa27.58■■■□□ 2.01
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Hsp90b1P08113 802 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ccne1Q61457 408 aa27.57■■■□□ 2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Filip1lQ6P6L0 1131 aa27.57■■■□□ 2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Atf5O70191 283 aa27.57■■■□□ 2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cwc27Q3TKY6 469 aa27.57■■■□□ 2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Glipr1l2Q9CQ35 332 aa27.57■■■□□ 2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Erich6bQ9D4S6 220 aa27.56■■■□□ 2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Abcc10Q8R4P9 1501 aa27.56■■■□□ 2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa27.55■■■□□ 2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rad17Q6NXW6 688 aa27.55■■■□□ 2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Disp3A3KFU9 1347 aa27.55■■■□□ 2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa27.55■■■□□ 2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Fez1Q8K0X8 392 aa27.55■■■□□ 2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Scn7aB1AYL1 1681 aa27.54■■■□□ 2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Phactr2B1AVP0 632 aa27.54■■■□□ 2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Sox12Q04890 314 aa27.54■■■□□ 2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Znf692Q3U381 531 aa27.54■■■□□ 2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Clcn1Q64347 994 aa27.54■■■□□ 2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 St18Q80TY4 1045 aa27.54■■■□□ 2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 HypkQ9CR41 129 aa27.54■■■□□ 2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Idi1P58044 227 aa27.53■■■□□ 2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Mum1Q6DID5 682 aa27.53■■■□□ 2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rims2Q9EQZ7 1530 aa27.53■■■□□ 2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Smarce1O54941 411 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Pdcl2Q78Y63 240 aa27.52■■■□□ 2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gadd45bP22339 160 aa27.52■■■□□ 2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Pnpla7A2AJ88 1352 aa27.52■■■□□ 2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Mon2Q80TL7 1715 aa27.51■■■□□ 2
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Syce3B5KM66 88 aa27.51■■□□□ 1.99
Ccsap-201ENSMUST00000034452 EvcP57680 1005 aa27.51■■□□□ 1.99
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Chpf2Q3UU43 768 aa27.5■■□□□ 1.99
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Hoxc9P09633 260 aa27.5■■□□□ 1.99
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gripap1Q8VD04 806 aa27.5■■□□□ 1.99
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Kif4P33174 1231 aa27.49■■□□□ 1.99
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cyp2d12Q8BVD2 504 aa27.49■■□□□ 1.99
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Tpx2A2APB8 745 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Tpm2P58774 284 aa27.49■■□□□ 1.99
Ccsap-201ENSMUST00000034452 KinQ8K339 391 aa27.49■■□□□ 1.99
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Tshz3Q8CGV9 1081 aa27.48■■□□□ 1.99
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Pmfbp1Q9WVQ0 1022 aa27.48■■□□□ 1.99
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Myo5bP21271 1818 aa27.48■■□□□ 1.99
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ccdc7Q9D541 371 aa27.48■■□□□ 1.99
Ccsap-201ENSMUST00000034452 PtprvP70289 1705 aa27.47■■□□□ 1.99
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Kdm4aQ8BW72 1064 aa27.47■■□□□ 1.99
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Chmp4cQ9D7F7 232 aa27.46■■□□□ 1.99
Ccsap-201ENSMUST00000034452 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa27.46■■□□□ 1.99
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Utp18Q5SSI6 552 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ush1cQ9ES64 910 aa27.46■■□□□ 1.99
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Strn4P58404 760 aa27.45■■□□□ 1.99
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ddx19aQ61655 478 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.99
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Jakmip1Q8BVL9 626 aa27.45■■□□□ 1.99
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ms4a2P20490 235 aa27.44■■□□□ 1.98
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Unc5clQ6R653 518 aa27.44■■□□□ 1.98
Ccsap-201ENSMUST00000034452 VgfQ0VGU4 617 aa27.44■■□□□ 1.98
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Pdzrn3Q69ZS0 1063 aa27.44■■□□□ 1.98
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cyp2d11P24457 504 aa27.43■■□□□ 1.98
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Tnnt1O88346 262 aa27.43■■□□□ 1.98
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ier5O89113 308 aa27.43■■□□□ 1.98
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa27.43■■□□□ 1.98
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cnksr1A2A9K7 700 aa27.42■■□□□ 1.98
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rcan3Q9JKK0 239 aa27.42■■□□□ 1.98
Ccsap-201ENSMUST00000034452 C5P06684 1680 aa27.42■■□□□ 1.98
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Als2Q920R0 1651 aa27.41■■□□□ 1.98
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cpa2Q504N0 417 aa27.41■■□□□ 1.98
Ccsap-201ENSMUST00000034452 CoilQ5SU73 570 aa27.41■■□□□ 1.98
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ints3Q7TPD0 1041 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm10563F6WIE4 79 aa27.4■■□□□ 1.98
Ccsap-201ENSMUST00000034452 DmtnQ9WV69 405 aa27.4■■□□□ 1.98
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Zscan25B2RX31 543 aa27.4■■□□□ 1.98
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Arfgef2A2A5R2 1792 aa27.39■■□□□ 1.98
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Becn1O88597 448 aa27.39■■□□□ 1.98
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cct4P80315 539 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Slx4ipQ9D7Y9 413 aa27.39■■□□□ 1.98
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Elmsan1E9Q2I4 1089 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ano8Q6PB70 1060 aa27.38■■□□□ 1.97
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Atg3Q9CPX6 314 aa27.38■■□□□ 1.97
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Tmem132eQ6IEE6 982 aa27.37■■□□□ 1.97
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rad50P70388 1312 aa27.37■■□□□ 1.97
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rnf214Q8BFU3 668 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Brpf1B2RRD7 1212 aa27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 38.6 ms