RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Msl1Q6PDM1 616 aa29.94■■■□□ 2.38
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sumf1Q8R0F3 372 aa29.91■■■□□ 2.38
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Myo5bP21271 1818 aa29.91■■■□□ 2.38
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Esx1O88933 382 aa29.86■■■□□ 2.37
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ubr3Q5U430 1889 aa29.85■■■□□ 2.37
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prom2Q3UUY6 835 aa29.81■■■□□ 2.36
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ppm1fQ8CGA0 452 aa29.78■■■□□ 2.36
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Clcn1Q64347 994 aa29.77■■■□□ 2.36
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Plch1Q4KWH5 1682 aa29.76■■■□□ 2.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kcna3P16390 528 aa29.75■■■□□ 2.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Stra8P70278 393 aa29.75■■■□□ 2.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Iqsec3Q3TES0 1195 aa29.75■■■□□ 2.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Egfem1Q8C088 590 aa29.75■■■□□ 2.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zbtb1Q91VL9 713 aa29.75■■■□□ 2.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zswim8Q3UHH1 1832 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Uspl1Q3ULM6 1089 aa29.74■■■□□ 2.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm12185Q5NCB2 835 aa29.74■■■□□ 2.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nip7Q9CXK8 180 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Znrd1-asQ8R0E5 213 aa29.72■■■□□ 2.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Col1a2Q01149 1372 aa29.72■■■□□ 2.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Eif4a1P60843 406 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Magea3Q6T340 320 aa29.7■■■□□ 2.35
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slfnl1Q8BHW9 410 aa29.7■■■□□ 2.35
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tlr8P58682 1032 aa29.67■■■□□ 2.34
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rapgef4Q9EQZ6 1011 aa29.67■■■□□ 2.34
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prr29B1ARI9 187 aa29.66■■■□□ 2.34
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 NrdcQ8BHG1 1161 aa29.66■■■□□ 2.34
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Taf7Q9R1C0 341 aa29.66■■■□□ 2.34
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Usp21Q9QZL6 566 aa29.65■■■□□ 2.34
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pibf1E9Q6K3 756 aa29.64■■■□□ 2.34
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tnnt1O88346 262 aa29.64■■■□□ 2.34
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 GckrQ91X44 587 aa29.64■■■□□ 2.34
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Klhdc4Q921I2 584 aa29.64■■■□□ 2.34
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gnai3Q9DC51 354 aa29.59■■■□□ 2.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sall2Q9QX96 1004 aa29.59■■■□□ 2.33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa29.58■■■□□ 2.33
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Q3TQI7 289 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
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