Protein–RNA interactions for Protein: P38351

PAF1, RNA polymerase II-associated protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PAF1P38351 MOT3YMR070W 1473 nt17.22■□□□□ 0.35
PAF1P38351 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt17.21■□□□□ 0.35
PAF1P38351 FMP45YDL222C 930 nt17.17■□□□□ 0.34
PAF1P38351 YJL152WYJL152W 360 nt17.17■□□□□ 0.34
PAF1P38351 SIS1YNL007C 1059 nt17.16■□□□□ 0.34
PAF1P38351 YPR011CYPR011C 981 nt17.16■□□□□ 0.34
PAF1P38351 YLR236CYLR236C 324 nt17.14■□□□□ 0.33
PAF1P38351 RPP2AYOL039W 321 nt17.03■□□□□ 0.32
PAF1P38351 YCH1YGR203W 447 nt17■□□□□ 0.31
PAF1P38351 MEP2YNL142W 1500 nt16.97■□□□□ 0.31
PAF1P38351 IDH1YNL037C 1083 nt16.97■□□□□ 0.31
PAF1P38351 TIR4YOR009W 1464 nt16.96■□□□□ 0.31
PAF1P38351 SPT5YML010W 3192 nt16.91■□□□□ 0.3
PAF1P38351 PTP1YDL230W 1008 nt16.87■□□□□ 0.29
PAF1P38351 ART5YGR068C 1761 nt16.85■□□□□ 0.29
PAF1P38351 LPX1YOR084W 1164 nt16.85■□□□□ 0.29
PAF1P38351 ERV46YAL042W 1248 nt16.84■□□□□ 0.29
PAF1P38351 PET9YBL030C 957 nt16.81■□□□□ 0.28
PAF1P38351 YDR433WYDR433W 441 nt16.8■□□□□ 0.28
PAF1P38351 GBP2YCL011C 1284 nt16.77■□□□□ 0.28
PAF1P38351 YMR057CYMR057C 372 nt16.76■□□□□ 0.27
PAF1P38351 CAC2YML102W 1407 nt16.76■□□□□ 0.27
PAF1P38351 GFD2YCL036W 1701 nt16.73■□□□□ 0.27
PAF1P38351 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt16.71■□□□□ 0.27
PAF1P38351 DCW1YKL046C 1350 nt16.7■□□□□ 0.26
PAF1P38351 YKR040CYKR040C 504 nt16.7■□□□□ 0.26
PAF1P38351 MRPL8YJL063C 717 nt16.66■□□□□ 0.26
PAF1P38351 SPP1YPL138C 1062 nt16.63■□□□□ 0.25
PAF1P38351 MXR2YCL033C 507 nt16.61■□□□□ 0.25
PAF1P38351 TCD2YKL027W 1344 nt16.55■□□□□ 0.24
PAF1P38351 EMI2YDR516C 1503 nt16.55■□□□□ 0.24
PAF1P38351 RTS2YOR077W 699 nt16.51■□□□□ 0.23
PAF1P38351 ADO1YJR105W 1023 nt16.48■□□□□ 0.23
PAF1P38351 FPS1YLL043W 2010 nt16.45■□□□□ 0.22
PAF1P38351 YDL221WYDL221W 552 nt16.44■□□□□ 0.22
PAF1P38351 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt16.44■□□□□ 0.22
PAF1P38351 YEL076CYEL076C 651 nt16.44■□□□□ 0.22
PAF1P38351 YLR464WYLR464W 651 nt16.44■□□□□ 0.22
PAF1P38351 YMR090WYMR090W 684 nt16.44■□□□□ 0.22
PAF1P38351 IRC15YPL017C 1500 nt16.42■□□□□ 0.22
PAF1P38351 RTG1YOL067C 534 nt16.42■□□□□ 0.22
PAF1P38351 RRD1YIL153W 1182 nt16.37■□□□□ 0.21
PAF1P38351 CUE1YMR264W 612 nt16.37■□□□□ 0.21
PAF1P38351 DED1YOR204W 1815 nt16.36■□□□□ 0.21
PAF1P38351 GIS3YLR094C 1509 nt16.29■□□□□ 0.2
PAF1P38351 FRD1YEL047C 1413 nt16.28■□□□□ 0.2
PAF1P38351 YCL042WYCL042W 360 nt16.24■□□□□ 0.19
PAF1P38351 YIL100WYIL100W 354 nt16.2■□□□□ 0.18
PAF1P38351 FMT1YBL013W 1206 nt16.19■□□□□ 0.18
PAF1P38351 SSA4YER103W 1929 nt16.19■□□□□ 0.18
PAF1P38351 HUA1YGR268C 597 nt16.18■□□□□ 0.18
PAF1P38351 SDH1YKL148C 1923 nt16.16■□□□□ 0.18
PAF1P38351 SOR2YDL246C 1074 nt16.16■□□□□ 0.18
PAF1P38351 SOR1YJR159W 1074 nt16.16■□□□□ 0.18
PAF1P38351 SCC4YER147C 1875 nt16.14■□□□□ 0.17
PAF1P38351 FMP52YER004W 696 nt16.12■□□□□ 0.17
PAF1P38351 PTH1YHR189W 573 nt16.11■□□□□ 0.17
PAF1P38351 YLR235CYLR235C 399 nt16.08■□□□□ 0.16
PAF1P38351 UBX6YJL048C 1191 nt16.07■□□□□ 0.16
PAF1P38351 YBR220CYBR220C 1683 nt16.07■□□□□ 0.16
PAF1P38351 CWP1YKL096W 720 nt16.04■□□□□ 0.16
PAF1P38351 YKL030WYKL030W 606 nt16.03■□□□□ 0.16
PAF1P38351 ADH2YMR303C 1047 nt15.98■□□□□ 0.15
PAF1P38351 LCB1YMR296C 1677 nt15.92■□□□□ 0.14
PAF1P38351 YDR094WYDR094W 336 nt15.88■□□□□ 0.13
PAF1P38351 YNL195CYNL195C 786 nt15.88■□□□□ 0.13
PAF1P38351 PCM1YEL058W 1674 nt15.88■□□□□ 0.13
PAF1P38351 SNF6YHL025W 999 nt15.86■□□□□ 0.13
PAF1P38351 DIC1YLR348C 897 nt15.81■□□□□ 0.12
PAF1P38351 TIM23YNR017W 669 nt15.8■□□□□ 0.12
PAF1P38351 RRT12YCR045C 1476 nt15.72■□□□□ 0.11
PAF1P38351 RNQ1YCL028W 1218 nt15.72■□□□□ 0.11
PAF1P38351 YIH1YCR059C 777 nt15.7■□□□□ 0.1
PAF1P38351 YLR179CYLR179C 606 nt15.7■□□□□ 0.1
PAF1P38351 YSC84YHR016C 1407 nt15.68■□□□□ 0.1
PAF1P38351 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt15.65■□□□□ 0.1
PAF1P38351 YPR064WYPR064W 420 nt15.62■□□□□ 0.09
PAF1P38351 YHL050CYHL050C 2094 nt15.58■□□□□ 0.09
PAF1P38351 SIM1YIL123W 1431 nt15.54■□□□□ 0.08
PAF1P38351 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt15.54■□□□□ 0.08
PAF1P38351 YLL053CYLL053C 459 nt15.54■□□□□ 0.08
PAF1P38351 BIO4YNR057C 714 nt15.54■□□□□ 0.08
PAF1P38351 TAD3YLR316C 969 nt15.53■□□□□ 0.08
PAF1P38351 AHT1YHR093W 549 nt15.51■□□□□ 0.07
PAF1P38351 WSC2YNL283C 1512 nt15.51■□□□□ 0.07
PAF1P38351 YFR018CYFR018C 1092 nt15.49■□□□□ 0.07
PAF1P38351 SEC11YIR022W 504 nt15.49■□□□□ 0.07
PAF1P38351 FTR1YER145C 1215 nt15.46■□□□□ 0.07
PAF1P38351 AQY1YPR192W 918 nt15.46■□□□□ 0.07
PAF1P38351 BDF1YLR399C 2061 nt15.46■□□□□ 0.07
PAF1P38351 RRT5YFR032C 870 nt15.42■□□□□ 0.06
PAF1P38351 PAU16YKL224C 372 nt15.41■□□□□ 0.06
PAF1P38351 GAL1YBR020W 1587 nt15.41■□□□□ 0.06
PAF1P38351 TRM5YHR070W 1500 nt15.36■□□□□ 0.05
PAF1P38351 PRE6YOL038W 765 nt15.35■□□□□ 0.05
PAF1P38351 TAT1YBR069C 1860 nt15.29■□□□□ 0.04
PAF1P38351 ERF2YLR246W 1080 nt15.29■□□□□ 0.04
PAF1P38351 STB1YNL309W 1263 nt15.29■□□□□ 0.04
PAF1P38351 PCH2YBR186W 1695 nt15.28■□□□□ 0.04
PAF1P38351 DDR2YOL052C-A 186 nt15.28■□□□□ 0.04
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