Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms