Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
SMG1Q96Q15 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
SMG1Q96Q15 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
SMG1Q96Q15 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
SMG1Q96Q15 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
SMG1Q96Q15 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
SMG1Q96Q15 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
SMG1Q96Q15 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
SMG1Q96Q15 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
SMG1Q96Q15 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
SMG1Q96Q15 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
SMG1Q96Q15 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
SMG1Q96Q15 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
SMG1Q96Q15 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
SMG1Q96Q15 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
SMG1Q96Q15 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
SMG1Q96Q15 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
SMG1Q96Q15 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
SMG1Q96Q15 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
SMG1Q96Q15 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
SMG1Q96Q15 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
SMG1Q96Q15 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
SMG1Q96Q15 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
SMG1Q96Q15 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
SMG1Q96Q15 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
SMG1Q96Q15 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SMG1Q96Q15 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SMG1Q96Q15 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SMG1Q96Q15 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SMG1Q96Q15 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SMG1Q96Q15 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
SMG1Q96Q15 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC-3.62□□□□□ -2.99
SMG1Q96Q15 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SMG1Q96Q15 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SMG1Q96Q15 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SMG1Q96Q15 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SMG1Q96Q15 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SMG1Q96Q15 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SMG1Q96Q15 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SMG1Q96Q15 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SMG1Q96Q15 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SMG1Q96Q15 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SMG1Q96Q15 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SMG1Q96Q15 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
SMG1Q96Q15 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SMG1Q96Q15 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SMG1Q96Q15 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SMG1Q96Q15 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SMG1Q96Q15 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-3.66□□□□□ -2.99
SMG1Q96Q15 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC-3.66□□□□□ -2.99
SMG1Q96Q15 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-3.66□□□□□ -2.99
SMG1Q96Q15 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
SMG1Q96Q15 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
SMG1Q96Q15 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
SMG1Q96Q15 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SMG1Q96Q15 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SMG1Q96Q15 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SMG1Q96Q15 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
SMG1Q96Q15 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC-3.68□□□□□ -3
SMG1Q96Q15 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
SMG1Q96Q15 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
SMG1Q96Q15 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
SMG1Q96Q15 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
SMG1Q96Q15 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
SMG1Q96Q15 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
SMG1Q96Q15 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
SMG1Q96Q15 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SMG1Q96Q15 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SMG1Q96Q15 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SMG1Q96Q15 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
SMG1Q96Q15 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
SMG1Q96Q15 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
SMG1Q96Q15 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
SMG1Q96Q15 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-3.72□□□□□ -3.01
SMG1Q96Q15 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC-3.72□□□□□ -3.01
SMG1Q96Q15 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-3.72□□□□□ -3.01
SMG1Q96Q15 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
SMG1Q96Q15 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
SMG1Q96Q15 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
SMG1Q96Q15 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
SMG1Q96Q15 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
SMG1Q96Q15 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
SMG1Q96Q15 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
SMG1Q96Q15 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
SMG1Q96Q15 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
SMG1Q96Q15 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
SMG1Q96Q15 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC-3.75□□□□□ -3.01
SMG1Q96Q15 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
SMG1Q96Q15 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
SMG1Q96Q15 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
SMG1Q96Q15 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
SMG1Q96Q15 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
SMG1Q96Q15 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
SMG1Q96Q15 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
SMG1Q96Q15 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
SMG1Q96Q15 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
SMG1Q96Q15 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
SMG1Q96Q15 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
SMG1Q96Q15 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
SMG1Q96Q15 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.3 ms