Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CGGBP1Q9UFW8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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