Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE82

SH3TC1, SH3 domain and tetratricopeptide repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3TC1Q8TE82 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3TC1Q8TE82 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms