Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
EXT1Q16394 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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EXT1Q16394 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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EXT1Q16394 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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EXT1Q16394 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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EXT1Q16394 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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EXT1Q16394 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXT1Q16394 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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