Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-5□□□□□ -3.21
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC-5.01□□□□□ -3.21
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-5.01□□□□□ -3.21
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC-5.01□□□□□ -3.21
NRXN3Q9Y4C0 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC-5.01□□□□□ -3.21
NRXN3Q9Y4C0 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-5.01□□□□□ -3.21
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
NRXN3Q9Y4C0 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
NRXN3Q9Y4C0 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-5.03□□□□□ -3.21
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-5.03□□□□□ -3.21
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC-5.03□□□□□ -3.21
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-5.03□□□□□ -3.21
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-5.04□□□□□ -3.22
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC-5.04□□□□□ -3.22
NRXN3Q9Y4C0 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-5.04□□□□□ -3.22
NRXN3Q9Y4C0 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-5.05□□□□□ -3.22
NRXN3Q9Y4C0 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-5.05□□□□□ -3.22
NRXN3Q9Y4C0 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-5.05□□□□□ -3.22
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC-5.05□□□□□ -3.22
NRXN3Q9Y4C0 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-5.05□□□□□ -3.22
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-5.05□□□□□ -3.22
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC-5.06□□□□□ -3.22
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-5.06□□□□□ -3.22
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC-5.06□□□□□ -3.22
NRXN3Q9Y4C0 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-5.06□□□□□ -3.22
NRXN3Q9Y4C0 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-5.07□□□□□ -3.22
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC-5.07□□□□□ -3.22
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-5.07□□□□□ -3.22
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-5.07□□□□□ -3.22
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC-5.07□□□□□ -3.22
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-5.07□□□□□ -3.22
NRXN3Q9Y4C0 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC-5.07□□□□□ -3.22
NRXN3Q9Y4C0 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
NRXN3Q9Y4C0 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-5.09□□□□□ -3.22
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-5.09□□□□□ -3.22
NRXN3Q9Y4C0 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-5.09□□□□□ -3.22
NRXN3Q9Y4C0 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC-5.09□□□□□ -3.22
NRXN3Q9Y4C0 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC-5.1□□□□□ -3.23
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-5.1□□□□□ -3.23
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-5.1□□□□□ -3.23
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC-5.12□□□□□ -3.23
NRXN3Q9Y4C0 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-5.12□□□□□ -3.23
NRXN3Q9Y4C0 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC-5.12□□□□□ -3.23
NRXN3Q9Y4C0 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC-5.12□□□□□ -3.23
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-5.12□□□□□ -3.23
NRXN3Q9Y4C0 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC-5.13□□□□□ -3.23
NRXN3Q9Y4C0 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC-5.13□□□□□ -3.23
NRXN3Q9Y4C0 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-5.14□□□□□ -3.23
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-5.14□□□□□ -3.23
NRXN3Q9Y4C0 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-5.15□□□□□ -3.23
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-5.15□□□□□ -3.23
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-5.15□□□□□ -3.23
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-5.15□□□□□ -3.23
NRXN3Q9Y4C0 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-5.15□□□□□ -3.23
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-5.15□□□□□ -3.23
NRXN3Q9Y4C0 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-5.15□□□□□ -3.23
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-5.16□□□□□ -3.24
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC-5.16□□□□□ -3.24
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-5.16□□□□□ -3.24
NRXN3Q9Y4C0 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-5.17□□□□□ -3.24
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-5.18□□□□□ -3.24
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC-5.18□□□□□ -3.24
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-5.18□□□□□ -3.24
NRXN3Q9Y4C0 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-5.18□□□□□ -3.24
NRXN3Q9Y4C0 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC-5.18□□□□□ -3.24
NRXN3Q9Y4C0 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC-5.18□□□□□ -3.24
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC-5.19□□□□□ -3.24
NRXN3Q9Y4C0 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC-5.19□□□□□ -3.24
NRXN3Q9Y4C0 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC-5.19□□□□□ -3.24
NRXN3Q9Y4C0 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC-5.19□□□□□ -3.24
NRXN3Q9Y4C0 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC-5.19□□□□□ -3.24
NRXN3Q9Y4C0 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC-5.19□□□□□ -3.24
NRXN3Q9Y4C0 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-5.2□□□□□ -3.24
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-5.21□□□□□ -3.24
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-5.21□□□□□ -3.24
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC-5.21□□□□□ -3.24
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-5.21□□□□□ -3.24
NRXN3Q9Y4C0 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-5.21□□□□□ -3.24
NRXN3Q9Y4C0 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-5.22□□□□□ -3.24
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC-5.22□□□□□ -3.24
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-5.22□□□□□ -3.24
NRXN3Q9Y4C0 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-5.23□□□□□ -3.25
NRXN3Q9Y4C0 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-5.23□□□□□ -3.25
NRXN3Q9Y4C0 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-5.23□□□□□ -3.25
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-5.23□□□□□ -3.25
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC-5.23□□□□□ -3.25
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC-5.23□□□□□ -3.25
NRXN3Q9Y4C0 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-5.24□□□□□ -3.25
NRXN3Q9Y4C0 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-5.24□□□□□ -3.25
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-5.25□□□□□ -3.25
NRXN3Q9Y4C0 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-5.25□□□□□ -3.25
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-5.26□□□□□ -3.25
NRXN3Q9Y4C0 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC-5.26□□□□□ -3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.4 ms