Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
SSPNQ14714 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SSPNQ14714 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SSPNQ14714 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SSPNQ14714 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SSPNQ14714 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SSPNQ14714 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SSPNQ14714 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SSPNQ14714 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SSPNQ14714 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SSPNQ14714 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SSPNQ14714 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SSPNQ14714 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SSPNQ14714 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SSPNQ14714 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SSPNQ14714 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SSPNQ14714 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
SSPNQ14714 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
SSPNQ14714 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SSPNQ14714 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SSPNQ14714 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SSPNQ14714 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SSPNQ14714 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SSPNQ14714 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SSPNQ14714 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SSPNQ14714 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SSPNQ14714 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SSPNQ14714 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SSPNQ14714 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SSPNQ14714 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SSPNQ14714 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SSPNQ14714 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SSPNQ14714 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SSPNQ14714 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SSPNQ14714 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SSPNQ14714 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SSPNQ14714 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SSPNQ14714 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SSPNQ14714 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SSPNQ14714 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SSPNQ14714 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SSPNQ14714 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SSPNQ14714 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SSPNQ14714 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SSPNQ14714 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
SSPNQ14714 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SSPNQ14714 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SSPNQ14714 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SSPNQ14714 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SSPNQ14714 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
SSPNQ14714 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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