Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
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