Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
APOFQ13790 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
APOFQ13790 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
APOFQ13790 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
APOFQ13790 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
APOFQ13790 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
APOFQ13790 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
APOFQ13790 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
APOFQ13790 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
APOFQ13790 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
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APOFQ13790 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
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APOFQ13790 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
APOFQ13790 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
APOFQ13790 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
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APOFQ13790 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
APOFQ13790 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
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APOFQ13790 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
APOFQ13790 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
APOFQ13790 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
APOFQ13790 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
APOFQ13790 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
APOFQ13790 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
APOFQ13790 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
APOFQ13790 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
APOFQ13790 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
APOFQ13790 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
APOFQ13790 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
APOFQ13790 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
APOFQ13790 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
APOFQ13790 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
APOFQ13790 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
APOFQ13790 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
APOFQ13790 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
APOFQ13790 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
APOFQ13790 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
APOFQ13790 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
APOFQ13790 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
APOFQ13790 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
APOFQ13790 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
APOFQ13790 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
APOFQ13790 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
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APOFQ13790 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
APOFQ13790 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
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APOFQ13790 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
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APOFQ13790 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
APOFQ13790 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
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APOFQ13790 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
APOFQ13790 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
APOFQ13790 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
APOFQ13790 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
APOFQ13790 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
APOFQ13790 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
APOFQ13790 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
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