Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CBX3Q13185 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CBX3Q13185 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CBX3Q13185 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CBX3Q13185 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CBX3Q13185 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CBX3Q13185 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CBX3Q13185 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CBX3Q13185 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CBX3Q13185 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CBX3Q13185 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CBX3Q13185 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CBX3Q13185 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CBX3Q13185 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CBX3Q13185 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CBX3Q13185 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CBX3Q13185 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CBX3Q13185 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CBX3Q13185 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CBX3Q13185 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CBX3Q13185 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CBX3Q13185 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CBX3Q13185 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CBX3Q13185 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CBX3Q13185 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CBX3Q13185 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CBX3Q13185 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CBX3Q13185 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CBX3Q13185 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CBX3Q13185 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CBX3Q13185 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CBX3Q13185 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CBX3Q13185 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CBX3Q13185 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CBX3Q13185 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CBX3Q13185 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CBX3Q13185 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CBX3Q13185 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CBX3Q13185 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CBX3Q13185 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CBX3Q13185 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CBX3Q13185 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CBX3Q13185 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CBX3Q13185 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CBX3Q13185 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CBX3Q13185 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CBX3Q13185 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174 ms