Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MTA1Q13330 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MTA1Q13330 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MTA1Q13330 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MTA1Q13330 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MTA1Q13330 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MTA1Q13330 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MTA1Q13330 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MTA1Q13330 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
MTA1Q13330 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
MTA1Q13330 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
MTA1Q13330 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
MTA1Q13330 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
MTA1Q13330 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
MTA1Q13330 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
MTA1Q13330 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
MTA1Q13330 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MTA1Q13330 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
MTA1Q13330 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.9 ms