Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SCN11AQ9UI33 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC-2.92□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SCN11AQ9UI33 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-2.94□□□□□ -2.88
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