Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
EIF4EBP1Q13541 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
EIF4EBP1Q13541 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
EIF4EBP1Q13541 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
EIF4EBP1Q13541 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
EIF4EBP1Q13541 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
EIF4EBP1Q13541 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.23□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
EIF4EBP1Q13541 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
EIF4EBP1Q13541 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
EIF4EBP1Q13541 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
EIF4EBP1Q13541 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
EIF4EBP1Q13541 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
EIF4EBP1Q13541 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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