Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MKRN4PQ13434 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
MKRN4PQ13434 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MKRN4PQ13434 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
MKRN4PQ13434 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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