Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPREP23469 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPREP23469 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPREP23469 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPREP23469 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPREP23469 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPREP23469 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPREP23469 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPREP23469 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPREP23469 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPREP23469 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPREP23469 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPREP23469 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPREP23469 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPREP23469 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPREP23469 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPREP23469 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPREP23469 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPREP23469 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPREP23469 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPREP23469 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPREP23469 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPREP23469 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPREP23469 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPREP23469 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPREP23469 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPREP23469 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPREP23469 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPREP23469 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPREP23469 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPREP23469 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPREP23469 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPREP23469 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPREP23469 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPREP23469 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPREP23469 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPREP23469 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPREP23469 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPREP23469 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPREP23469 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPREP23469 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPREP23469 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPREP23469 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPREP23469 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPREP23469 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPREP23469 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPREP23469 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPREP23469 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPREP23469 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPREP23469 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPREP23469 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPREP23469 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPREP23469 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPREP23469 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPREP23469 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPREP23469 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPREP23469 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPREP23469 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPREP23469 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPREP23469 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPREP23469 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPREP23469 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPREP23469 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPREP23469 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPREP23469 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPREP23469 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPREP23469 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPREP23469 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPREP23469 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPREP23469 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPREP23469 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPREP23469 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPREP23469 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPREP23469 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPREP23469 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPREP23469 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPREP23469 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPREP23469 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPREP23469 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPREP23469 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPREP23469 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPREP23469 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPREP23469 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPREP23469 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPREP23469 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPREP23469 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPREP23469 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPREP23469 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPREP23469 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPREP23469 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPREP23469 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPREP23469 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPREP23469 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPREP23469 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPREP23469 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPREP23469 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPREP23469 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPREP23469 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPREP23469 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPREP23469 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
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