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Protein–RNA interactions for Protein: Q14563
SEMA3A, Semaphorin-3A, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SEMA3A
Q14563
SNORA16.1-201
ENST00000364597
132 nt
BASIC
1.83
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
RNU6-296P-201
ENST00000384608
107 nt
BASIC
1.83
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
MIR9-3-201
ENST00000385084
90 nt
BASIC
1.83
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
MIRLET7F2-201
ENST00000385277
83 nt
BASIC
1.83
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
MIR764-201
ENST00000390811
85 nt
BASIC
1.83
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
AL034345.1-201
ENST00000407768
123 nt
BASIC
1.83
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
AC023449.1-201
ENST00000454464
154 nt
BASIC
1.83
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
snoU13.27-201
ENST00000459278
104 nt
BASIC
1.83
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
RNU7-34P-201
ENST00000459394
64 nt
BASIC
1.83
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
AC122707.1-201
ENST00000502882
219 nt
TSL 2
BASIC
1.83
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
RNU6-1061P-201
ENST00000516530
99 nt
BASIC
1.83
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
SNORA31.17-201
ENST00000516953
127 nt
BASIC
1.83
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
RNU6-365P-201
ENST00000517113
106 nt
BASIC
1.83
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
AC133485.4-201
ENST00000561835
220 nt
BASIC
1.83
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
AC138907.4-201
ENST00000570107
226 nt
BASIC
1.83
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
MIR4709-201
ENST00000577272
72 nt
BASIC
1.83
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.757-201
ENST00000578934
114 nt
BASIC
1.83
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
AC036222.2-201
ENST00000579033
333 nt
TSL 3
BASIC
1.83
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
MIR4285-201
ENST00000581001
85 nt
BASIC
1.83
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
AL022345.2-201
ENST00000606307
135 nt
BASIC
1.83
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
GABRA2-209
ENST00000510861
3411 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
1.83
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
TEX15-203
ENST00000638951
11341 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
1.83
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
MIR126-201
ENST00000362291
85 nt
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
RNU6-1298P-201
ENST00000362456
101 nt
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
MIR518F-201
ENST00000384973
87 nt
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
MIR522-201
ENST00000385071
87 nt
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
RNU6-360P-201
ENST00000390944
104 nt
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
SNORD77.3-201
ENST00000391113
65 nt
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
RNA5SP482-201
ENST00000391269
118 nt
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
RNA5SP127-201
ENST00000411051
133 nt
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
AF228730.3-201
ENST00000436691
102 nt
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
AL603825.1-201
ENST00000438481
80 nt
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
SNORA18.4-201
ENST00000516440
124 nt
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
PLD1-217
ENST00000627725
174 nt
TSL 5
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
AC068733.3-201
ENST00000632757
269 nt
TSL 3
BASIC
1.82
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
RNU6-661P-201
ENST00000362409
107 nt
BASIC
1.81
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.35-201
ENST00000362601
101 nt
BASIC
1.81
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
RNU6-888P-201
ENST00000363010
101 nt
BASIC
1.81
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
SNORA22-201
ENST00000383907
134 nt
BASIC
1.81
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
AL590705.2-201
ENST00000420204
281 nt
TSL 5
BASIC
1.81
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
AC063976.4-201
ENST00000421971
163 nt
BASIC
1.81
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
RNA5SP182-201
ENST00000516064
82 nt
BASIC
1.81
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
SCARNA15-202
ENST00000516881
127 nt
BASIC
1.81
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
RNA5SP437-201
ENST00000517249
129 nt
BASIC
1.81
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
MIR4662B-201
ENST00000579498
81 nt
BASIC
1.81
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
FANCD2-213
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TSL 5
BASIC
1.81
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
LMBR1-222
ENST00000638959
93 nt
TSL 5
BASIC
1.81
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
AC007370.2-201
ENST00000506899
2694 nt
TSL 5
BASIC
1.81
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
RNU6-414P-201
ENST00000363705
104 nt
BASIC
1.8
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
TRAJ23-201
ENST00000390514
63 nt
APPRIS P1
BASIC
1.8
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
AL031386.1-201
ENST00000411940
142 nt
TSL 5
BASIC
1.8
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
SNRPGP14-201
ENST00000435400
219 nt
BASIC
1.8
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
STAG3L5P-204
ENST00000443759
179 nt
BASIC
1.8
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
RN7SKP19-201
ENST00000516016
252 nt
BASIC
1.8
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
RNU6-504P-201
ENST00000516568
104 nt
BASIC
1.8
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
IGHVIII-67-2-201
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BASIC
1.8
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
SNORD68-201
ENST00000363214
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BASIC
1.79
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
RNU6-755P-201
ENST00000364400
103 nt
BASIC
1.79
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
SNORA4.2-201
ENST00000365313
147 nt
BASIC
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□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
MIR548A1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
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BASIC
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SEMA3A
Q14563
RNU6-1149P-201
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BASIC
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SEMA3A
Q14563
RNU6-548P-201
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BASIC
1.79
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
MIR4419B-201
ENST00000577260
68 nt
BASIC
1.79
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
KIAA1107-201
ENST00000370378
4622 nt
TSL 5
BASIC
1.79
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
CEP57L1-213
ENST00000520883
2055 nt
TSL 5
BASIC
1.79
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
ICE2P2-201
ENST00000483823
2787 nt
BASIC
1.78
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
SNORD48-201
ENST00000364953
64 nt
BASIC
1.78
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
SNORD24-201
ENST00000383884
75 nt
BASIC
1.78
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
RNU6-147P-201
ENST00000383983
107 nt
BASIC
1.78
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
SNORA40.18-201
ENST00000391200
128 nt
BASIC
1.78
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
SNORA26-201
ENST00000391286
122 nt
BASIC
1.78
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
CALM2P4-201
ENST00000430810
426 nt
BASIC
1.78
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
HMGN2P23-201
ENST00000456759
269 nt
BASIC
1.78
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
CYCTP-201
ENST00000504253
315 nt
BASIC
1.78
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.676-201
ENST00000516393
96 nt
BASIC
1.78
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
RNU7-25P-201
ENST00000516544
62 nt
BASIC
1.78
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
RNU6-1116P-201
ENST00000517269
99 nt
BASIC
1.78
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
MIR3613-201
ENST00000579844
87 nt
BASIC
1.78
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
U6.95-201
ENST00000636931
70 nt
BASIC
1.78
□□□□□ -2.12
SEMA3A
Q14563
SNORD18B-201
ENST00000365659
72 nt
BASIC
1.77
□□□□□ -2.13
SEMA3A
Q14563
RNU6-1031P-201
ENST00000384773
107 nt
BASIC
1.77
□□□□□ -2.13
SEMA3A
Q14563
U8.13-201
ENST00000390842
128 nt
BASIC
1.77
□□□□□ -2.13
SEMA3A
Q14563
RNU6-970P-201
ENST00000516312
107 nt
BASIC
1.77
□□□□□ -2.13
SEMA3A
Q14563
SNORA31.10-201
ENST00000516482
106 nt
BASIC
1.77
□□□□□ -2.13
SEMA3A
Q14563
AL670379.3-201
ENST00000605040
251 nt
BASIC
1.77
□□□□□ -2.13
SEMA3A
Q14563
AL353997.5-201
ENST00000618886
171 nt
BASIC
1.77
□□□□□ -2.13
SEMA3A
Q14563
KIAA1551-201
ENST00000312561
6230 nt
APPRIS P1
TSL 1 (best)
BASIC
1.77
□□□□□ -2.13
SEMA3A
Q14563
MTND5P18-201
ENST00000445624
1801 nt
BASIC
1.77
□□□□□ -2.13
SEMA3A
Q14563
RNU6-1084P-201
ENST00000362498
107 nt
BASIC
1.76
□□□□□ -2.13
SEMA3A
Q14563
RNA5SP99-201
ENST00000364020
114 nt
BASIC
1.76
□□□□□ -2.13
SEMA3A
Q14563
RNU6-268P-201
ENST00000364174
107 nt
BASIC
1.76
□□□□□ -2.13
SEMA3A
Q14563
RNU6-647P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.13
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.366-201
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102 nt
BASIC
1.76
□□□□□ -2.13
SEMA3A
Q14563
RNU6-1292P-201
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107 nt
BASIC
1.76
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SEMA3A
Q14563
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ENST00000384188
106 nt
BASIC
1.76
□□□□□ -2.13
SEMA3A
Q14563
SNORD116-21-201
ENST00000384507
92 nt
BASIC
1.76
□□□□□ -2.13
SEMA3A
Q14563
MIR548A3-201
ENST00000385297
97 nt
BASIC
1.76
□□□□□ -2.13
SEMA3A
Q14563
5S_rRNA.2-201
ENST00000391293
112 nt
BASIC
1.76
□□□□□ -2.13
SEMA3A
Q14563
MIR1263-201
ENST00000408324
86 nt
BASIC
1.76
□□□□□ -2.13
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