Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
SCN9AQ15858 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
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