Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRIP3Q6Q6R5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms