Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCSO14618 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCSO14618 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCSO14618 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCSO14618 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCSO14618 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCSO14618 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCSO14618 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCSO14618 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCSO14618 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCSO14618 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCSO14618 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCSO14618 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCSO14618 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCSO14618 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCSO14618 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCSO14618 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCSO14618 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCSO14618 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCSO14618 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCSO14618 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCSO14618 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCSO14618 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCSO14618 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCSO14618 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCSO14618 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCSO14618 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCSO14618 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCSO14618 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCSO14618 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCSO14618 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCSO14618 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCSO14618 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCSO14618 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCSO14618 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCSO14618 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCSO14618 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCSO14618 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCSO14618 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCSO14618 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCSO14618 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCSO14618 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCSO14618 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCSO14618 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCSO14618 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCSO14618 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCSO14618 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCSO14618 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCSO14618 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCSO14618 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCSO14618 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCSO14618 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCSO14618 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCSO14618 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCSO14618 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCSO14618 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCSO14618 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCSO14618 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCSO14618 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCSO14618 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCSO14618 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCSO14618 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCSO14618 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCSO14618 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCSO14618 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCSO14618 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCSO14618 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCSO14618 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCSO14618 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCSO14618 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCSO14618 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCSO14618 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCSO14618 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCSO14618 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCSO14618 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCSO14618 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCSO14618 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCSO14618 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCSO14618 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCSO14618 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCSO14618 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCSO14618 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCSO14618 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCSO14618 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCSO14618 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCSO14618 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCSO14618 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCSO14618 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCSO14618 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCSO14618 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCSO14618 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCSO14618 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCSO14618 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCSO14618 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCSO14618 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCSO14618 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCSO14618 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCSO14618 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCSO14618 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCSO14618 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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