Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VPREB3Q9UKI3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB3Q9UKI3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.7 ms