Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPARGC1BQ86YN6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPARGC1BQ86YN6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
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