Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ARID3CA6NKF2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms