Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRTO14522 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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