Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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