Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
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