Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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HIF1AQ16665 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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HIF1AQ16665 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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