Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3KRW8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3KRW8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
J3KRW8 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KRW8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KRW8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KRW8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KRW8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KRW8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KRW8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KRW8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KRW8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KRW8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KRW8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KRW8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KRW8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KRW8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KRW8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KRW8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KRW8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KRW8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KRW8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KRW8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
J3KRW8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
J3KRW8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
J3KRW8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
J3KRW8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
J3KRW8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
J3KRW8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
J3KRW8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
J3KRW8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
J3KRW8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KRW8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KRW8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KRW8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KRW8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KRW8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KRW8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KRW8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KRW8 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KRW8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KRW8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KRW8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KRW8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KRW8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KRW8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KRW8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KRW8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KRW8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KRW8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KRW8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KRW8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KRW8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KRW8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KRW8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KRW8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KRW8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KRW8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KRW8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KRW8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KRW8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
J3KRW8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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