Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO4Q9UKT5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO4Q9UKT5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO4Q9UKT5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO4Q9UKT5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO4Q9UKT5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO4Q9UKT5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO4Q9UKT5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO4Q9UKT5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO4Q9UKT5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO4Q9UKT5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO4Q9UKT5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO4Q9UKT5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO4Q9UKT5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO4Q9UKT5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO4Q9UKT5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO4Q9UKT5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO4Q9UKT5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO4Q9UKT5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO4Q9UKT5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO4Q9UKT5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO4Q9UKT5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO4Q9UKT5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO4Q9UKT5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO4Q9UKT5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO4Q9UKT5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO4Q9UKT5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO4Q9UKT5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO4Q9UKT5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO4Q9UKT5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO4Q9UKT5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO4Q9UKT5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO4Q9UKT5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO4Q9UKT5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO4Q9UKT5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO4Q9UKT5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO4Q9UKT5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FBXO4Q9UKT5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FBXO4Q9UKT5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO4Q9UKT5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO4Q9UKT5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO4Q9UKT5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO4Q9UKT5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO4Q9UKT5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO4Q9UKT5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO4Q9UKT5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO4Q9UKT5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO4Q9UKT5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO4Q9UKT5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO4Q9UKT5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO4Q9UKT5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO4Q9UKT5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO4Q9UKT5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO4Q9UKT5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO4Q9UKT5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO4Q9UKT5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO4Q9UKT5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO4Q9UKT5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO4Q9UKT5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO4Q9UKT5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO4Q9UKT5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO4Q9UKT5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO4Q9UKT5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO4Q9UKT5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO4Q9UKT5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.2 ms