Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCB6Q9NP58 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCB6Q9NP58 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCB6Q9NP58 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCB6Q9NP58 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCB6Q9NP58 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCB6Q9NP58 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCB6Q9NP58 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCB6Q9NP58 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCB6Q9NP58 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCB6Q9NP58 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCB6Q9NP58 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCB6Q9NP58 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCB6Q9NP58 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCB6Q9NP58 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCB6Q9NP58 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCB6Q9NP58 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCB6Q9NP58 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCB6Q9NP58 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCB6Q9NP58 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ABCB6Q9NP58 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCB6Q9NP58 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCB6Q9NP58 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCB6Q9NP58 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCB6Q9NP58 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ABCB6Q9NP58 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ABCB6Q9NP58 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCB6Q9NP58 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCB6Q9NP58 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCB6Q9NP58 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCB6Q9NP58 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCB6Q9NP58 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCB6Q9NP58 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCB6Q9NP58 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCB6Q9NP58 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCB6Q9NP58 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCB6Q9NP58 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCB6Q9NP58 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCB6Q9NP58 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCB6Q9NP58 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCB6Q9NP58 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCB6Q9NP58 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ABCB6Q9NP58 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ABCB6Q9NP58 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ABCB6Q9NP58 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCB6Q9NP58 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCB6Q9NP58 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCB6Q9NP58 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCB6Q9NP58 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCB6Q9NP58 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCB6Q9NP58 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCB6Q9NP58 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCB6Q9NP58 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCB6Q9NP58 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCB6Q9NP58 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCB6Q9NP58 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCB6Q9NP58 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCB6Q9NP58 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCB6Q9NP58 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCB6Q9NP58 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCB6Q9NP58 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCB6Q9NP58 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms