Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPSB1Q96BD6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SPSB1Q96BD6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPSB1Q96BD6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPSB1Q96BD6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPSB1Q96BD6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPSB1Q96BD6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPSB1Q96BD6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPSB1Q96BD6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPSB1Q96BD6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPSB1Q96BD6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPSB1Q96BD6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPSB1Q96BD6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPSB1Q96BD6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPSB1Q96BD6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPSB1Q96BD6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SPSB1Q96BD6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPSB1Q96BD6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPSB1Q96BD6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPSB1Q96BD6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPSB1Q96BD6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPSB1Q96BD6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SPSB1Q96BD6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPSB1Q96BD6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPSB1Q96BD6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPSB1Q96BD6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPSB1Q96BD6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPSB1Q96BD6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPSB1Q96BD6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPSB1Q96BD6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPSB1Q96BD6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPSB1Q96BD6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPSB1Q96BD6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPSB1Q96BD6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPSB1Q96BD6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPSB1Q96BD6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPSB1Q96BD6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPSB1Q96BD6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPSB1Q96BD6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPSB1Q96BD6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPSB1Q96BD6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPSB1Q96BD6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPSB1Q96BD6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPSB1Q96BD6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPSB1Q96BD6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPSB1Q96BD6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPSB1Q96BD6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPSB1Q96BD6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPSB1Q96BD6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPSB1Q96BD6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPSB1Q96BD6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPSB1Q96BD6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPSB1Q96BD6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPSB1Q96BD6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPSB1Q96BD6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPSB1Q96BD6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPSB1Q96BD6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPSB1Q96BD6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPSB1Q96BD6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPSB1Q96BD6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPSB1Q96BD6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPSB1Q96BD6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPSB1Q96BD6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPSB1Q96BD6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPSB1Q96BD6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPSB1Q96BD6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPSB1Q96BD6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPSB1Q96BD6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPSB1Q96BD6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPSB1Q96BD6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SPSB1Q96BD6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPSB1Q96BD6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPSB1Q96BD6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPSB1Q96BD6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPSB1Q96BD6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPSB1Q96BD6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPSB1Q96BD6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPSB1Q96BD6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPSB1Q96BD6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPSB1Q96BD6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPSB1Q96BD6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPSB1Q96BD6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPSB1Q96BD6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPSB1Q96BD6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPSB1Q96BD6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SPSB1Q96BD6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPSB1Q96BD6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPSB1Q96BD6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPSB1Q96BD6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPSB1Q96BD6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPSB1Q96BD6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPSB1Q96BD6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPSB1Q96BD6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPSB1Q96BD6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPSB1Q96BD6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPSB1Q96BD6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPSB1Q96BD6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPSB1Q96BD6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPSB1Q96BD6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SPSB1Q96BD6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms