Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sys1Q78S06 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sys1Q78S06 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sys1Q78S06 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sys1Q78S06 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sys1Q78S06 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sys1Q78S06 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sys1Q78S06 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sys1Q78S06 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sys1Q78S06 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sys1Q78S06 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sys1Q78S06 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sys1Q78S06 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sys1Q78S06 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sys1Q78S06 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sys1Q78S06 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sys1Q78S06 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sys1Q78S06 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sys1Q78S06 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sys1Q78S06 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sys1Q78S06 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sys1Q78S06 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sys1Q78S06 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sys1Q78S06 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sys1Q78S06 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sys1Q78S06 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sys1Q78S06 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sys1Q78S06 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sys1Q78S06 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sys1Q78S06 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sys1Q78S06 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sys1Q78S06 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sys1Q78S06 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sys1Q78S06 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sys1Q78S06 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sys1Q78S06 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sys1Q78S06 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sys1Q78S06 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sys1Q78S06 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sys1Q78S06 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sys1Q78S06 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sys1Q78S06 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sys1Q78S06 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sys1Q78S06 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sys1Q78S06 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sys1Q78S06 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sys1Q78S06 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sys1Q78S06 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sys1Q78S06 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sys1Q78S06 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sys1Q78S06 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sys1Q78S06 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sys1Q78S06 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sys1Q78S06 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sys1Q78S06 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sys1Q78S06 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sys1Q78S06 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sys1Q78S06 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sys1Q78S06 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sys1Q78S06 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sys1Q78S06 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sys1Q78S06 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sys1Q78S06 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sys1Q78S06 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sys1Q78S06 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sys1Q78S06 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms