Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 SNU66YOR308C 1764 nt7.83□□□□□ -1.16
LDB17Q12342 MET30YIL046W 1923 nt7.82□□□□□ -1.16
LDB17Q12342 GRH1YDR517W 1119 nt7.82□□□□□ -1.16
LDB17Q12342 MRP7YNL005C 1116 nt7.82□□□□□ -1.16
LDB17Q12342 GDH1YOR375C 1365 nt7.82□□□□□ -1.16
LDB17Q12342 TAD2YJL035C 753 nt7.81□□□□□ -1.16
LDB17Q12342 PAU21YOR394W 495 nt7.81□□□□□ -1.16
LDB17Q12342 PAU22YPL282C 495 nt7.81□□□□□ -1.16
LDB17Q12342 SLM3YDL033C 1254 nt7.8□□□□□ -1.16
LDB17Q12342 TDH1YJL052W 999 nt7.8□□□□□ -1.16
LDB17Q12342 YNL190WYNL190W 615 nt7.8□□□□□ -1.16
LDB17Q12342 ARG7YMR062C 1326 nt7.79□□□□□ -1.16
LDB17Q12342 ELP4YPL101W 1371 nt7.79□□□□□ -1.16
LDB17Q12342 KTR4YBR199W 1395 nt7.79□□□□□ -1.16
LDB17Q12342 YIL168WYIL168W 384 nt7.78□□□□□ -1.16
LDB17Q12342 RTG2YGL252C 1767 nt7.77□□□□□ -1.17
LDB17Q12342 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.77□□□□□ -1.17
LDB17Q12342 Q0010Q0010 387 nt7.77□□□□□ -1.17
LDB17Q12342 MET13YGL125W 1803 nt7.76□□□□□ -1.17
LDB17Q12342 SNP1YIL061C 903 nt7.76□□□□□ -1.17
LDB17Q12342 LAS17YOR181W 1902 nt7.76□□□□□ -1.17
LDB17Q12342 ADE2YOR128C 1716 nt7.75□□□□□ -1.17
LDB17Q12342 HRA1HRA1 564 nt7.75□□□□□ -1.17
LDB17Q12342 ELP6YMR312W 822 nt7.75□□□□□ -1.17
LDB17Q12342 YOR343CYOR343C 327 nt7.75□□□□□ -1.17
LDB17Q12342 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.74□□□□□ -1.17
LDB17Q12342 CPR2YHR057C 618 nt7.74□□□□□ -1.17
LDB17Q12342 AIM34YMR003W 597 nt7.74□□□□□ -1.17
LDB17Q12342 NUP53YMR153W 1428 nt7.72□□□□□ -1.17
LDB17Q12342 ADE1YAR015W 921 nt7.72□□□□□ -1.17
LDB17Q12342 PSP2YML017W 1782 nt7.71□□□□□ -1.17
LDB17Q12342 PMT1YDL095W 2454 nt7.71□□□□□ -1.17
LDB17Q12342 ITR1YDR497C 1755 nt7.7□□□□□ -1.18
LDB17Q12342 DST1YGL043W 930 nt7.7□□□□□ -1.18
LDB17Q12342 BUD20YLR074C 501 nt7.7□□□□□ -1.18
LDB17Q12342 MTC6YHR151C 1581 nt7.69□□□□□ -1.18
LDB17Q12342 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.69□□□□□ -1.18
LDB17Q12342 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.69□□□□□ -1.18
LDB17Q12342 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.69□□□□□ -1.18
LDB17Q12342 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.69□□□□□ -1.18
LDB17Q12342 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.69□□□□□ -1.18
LDB17Q12342 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.69□□□□□ -1.18
LDB17Q12342 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.69□□□□□ -1.18
LDB17Q12342 CDA1YLR307W 906 nt7.69□□□□□ -1.18
LDB17Q12342 APT1YML022W 564 nt7.69□□□□□ -1.18
LDB17Q12342 TPO1YLL028W 1761 nt7.69□□□□□ -1.18
LDB17Q12342 PRC1YMR297W 1599 nt7.68□□□□□ -1.18
LDB17Q12342 MNN9YPL050C 1188 nt7.68□□□□□ -1.18
LDB17Q12342 GCD11YER025W 1584 nt7.67□□□□□ -1.18
LDB17Q12342 SGF73YGL066W 1974 nt7.67□□□□□ -1.18
LDB17Q12342 TES1YJR019C 1050 nt7.66□□□□□ -1.18
LDB17Q12342 CPT1YNL130C 1182 nt7.66□□□□□ -1.18
LDB17Q12342 SPR1YOR190W 1338 nt7.66□□□□□ -1.18
LDB17Q12342 CHA1YCL064C 1083 nt7.65□□□□□ -1.18
LDB17Q12342 AOS1YPR180W 1044 nt7.65□□□□□ -1.18
LDB17Q12342 STE3YKL178C 1413 nt7.64□□□□□ -1.19
LDB17Q12342 YJL043WYJL043W 774 nt7.64□□□□□ -1.19
LDB17Q12342 PNS1YOR161C 1620 nt7.63□□□□□ -1.19
LDB17Q12342 HAC1YFL031W 717 nt7.63□□□□□ -1.19
LDB17Q12342 RRT6YGL146C 936 nt7.63□□□□□ -1.19
LDB17Q12342 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.63□□□□□ -1.19
LDB17Q12342 YPL264CYPL264C 1062 nt7.63□□□□□ -1.19
LDB17Q12342 TOP3YLR234W 1971 nt7.62□□□□□ -1.19
LDB17Q12342 HXT9YJL219W 1704 nt7.62□□□□□ -1.19
LDB17Q12342 CKB1YGL019W 837 nt7.62□□□□□ -1.19
LDB17Q12342 FUS3YBL016W 1062 nt7.62□□□□□ -1.19
LDB17Q12342 MAM3YOL060C 2121 nt7.62□□□□□ -1.19
LDB17Q12342 PDC5YLR134W 1692 nt7.62□□□□□ -1.19
LDB17Q12342 AVL9YLR114C 2295 nt7.62□□□□□ -1.19
LDB17Q12342 TOS1YBR162C 1368 nt7.61□□□□□ -1.19
LDB17Q12342 BEM1YBR200W 1656 nt7.61□□□□□ -1.19
LDB17Q12342 RPL12BYDR418W 498 nt7.61□□□□□ -1.19
LDB17Q12342 YHR033WYHR033W 1272 nt7.61□□□□□ -1.19
LDB17Q12342 HAM1YJR069C 594 nt7.61□□□□□ -1.19
LDB17Q12342 YNL295WYNL295W 1575 nt7.61□□□□□ -1.19
LDB17Q12342 PEX28YHR150W 1740 nt7.61□□□□□ -1.19
LDB17Q12342 RSC9YML127W 1746 nt7.61□□□□□ -1.19
LDB17Q12342 RRP43YCR035C 1185 nt7.6□□□□□ -1.19
LDB17Q12342 SPE4YLR146C 903 nt7.6□□□□□ -1.19
LDB17Q12342 YEL023CYEL023C 2049 nt7.6□□□□□ -1.19
LDB17Q12342 YER152CYER152C 1332 nt7.58□□□□□ -1.2
LDB17Q12342 YJL045WYJL045W 1905 nt7.58□□□□□ -1.2
LDB17Q12342 ECM10YEL030W 1935 nt7.57□□□□□ -1.2
LDB17Q12342 YDR215CYDR215C 414 nt7.57□□□□□ -1.2
LDB17Q12342 YDR476CYDR476C 675 nt7.57□□□□□ -1.2
LDB17Q12342 ATP10YLR393W 840 nt7.57□□□□□ -1.2
LDB17Q12342 RUP1YOR138C 2016 nt7.57□□□□□ -1.2
LDB17Q12342 PMA2YPL036W 2844 nt7.56□□□□□ -1.2
LDB17Q12342 EDC2YER035W 438 nt7.56□□□□□ -1.2
LDB17Q12342 INP54YOL065C 1155 nt7.56□□□□□ -1.2
LDB17Q12342 FRT1YOR324C 1809 nt7.56□□□□□ -1.2
LDB17Q12342 CRN1YLR429W 1956 nt7.55□□□□□ -1.2
LDB17Q12342 PET10YKR046C 852 nt7.55□□□□□ -1.2
LDB17Q12342 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.54□□□□□ -1.2
LDB17Q12342 ERV2YPR037C 591 nt7.54□□□□□ -1.2
LDB17Q12342 PET494YNR045W 1470 nt7.54□□□□□ -1.2
LDB17Q12342 SNF7YLR025W 723 nt7.53□□□□□ -1.2
LDB17Q12342 VPS65YLR322W 315 nt7.53□□□□□ -1.2
LDB17Q12342 ERR3YMR323W 1314 nt7.52□□□□□ -1.2
LDB17Q12342 ERR1YOR393W 1314 nt7.52□□□□□ -1.2
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