Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNRPEP62304 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNRPEP62304 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNRPEP62304 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNRPEP62304 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNRPEP62304 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNRPEP62304 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNRPEP62304 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNRPEP62304 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNRPEP62304 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNRPEP62304 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNRPEP62304 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNRPEP62304 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNRPEP62304 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNRPEP62304 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNRPEP62304 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNRPEP62304 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNRPEP62304 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SNRPEP62304 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNRPEP62304 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNRPEP62304 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNRPEP62304 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNRPEP62304 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNRPEP62304 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNRPEP62304 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SNRPEP62304 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNRPEP62304 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNRPEP62304 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNRPEP62304 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNRPEP62304 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNRPEP62304 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNRPEP62304 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNRPEP62304 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNRPEP62304 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNRPEP62304 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SNRPEP62304 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SNRPEP62304 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNRPEP62304 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SNRPEP62304 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNRPEP62304 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNRPEP62304 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNRPEP62304 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNRPEP62304 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNRPEP62304 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNRPEP62304 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNRPEP62304 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNRPEP62304 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNRPEP62304 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNRPEP62304 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNRPEP62304 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNRPEP62304 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNRPEP62304 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNRPEP62304 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNRPEP62304 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNRPEP62304 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNRPEP62304 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNRPEP62304 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNRPEP62304 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNRPEP62304 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNRPEP62304 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNRPEP62304 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNRPEP62304 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNRPEP62304 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNRPEP62304 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNRPEP62304 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNRPEP62304 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNRPEP62304 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNRPEP62304 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNRPEP62304 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNRPEP62304 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNRPEP62304 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNRPEP62304 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNRPEP62304 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNRPEP62304 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNRPEP62304 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNRPEP62304 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SNRPEP62304 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNRPEP62304 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNRPEP62304 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNRPEP62304 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNRPEP62304 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNRPEP62304 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNRPEP62304 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNRPEP62304 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNRPEP62304 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNRPEP62304 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNRPEP62304 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNRPEP62304 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNRPEP62304 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNRPEP62304 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNRPEP62304 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNRPEP62304 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNRPEP62304 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNRPEP62304 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNRPEP62304 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNRPEP62304 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SNRPEP62304 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNRPEP62304 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNRPEP62304 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNRPEP62304 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms