Protein–RNA interactions for Protein: P53437

RRN9, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN9, yeastyeast

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN9P53437 ARO3YDR035W 1113 nt7.12□□□□□ -1.27
RRN9P53437 NAP1YKR048C 1254 nt7.12□□□□□ -1.27
RRN9P53437 AFG2YLR397C 2343 nt7.12□□□□□ -1.27
RRN9P53437 ALG7YBR243C 1347 nt7.11□□□□□ -1.27
RRN9P53437 YMR253CYMR253C 1245 nt7.11□□□□□ -1.27
RRN9P53437 YPL108WYPL108W 507 nt7.11□□□□□ -1.27
RRN9P53437 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.1□□□□□ -1.27
RRN9P53437 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.1□□□□□ -1.27
RRN9P53437 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.1□□□□□ -1.27
RRN9P53437 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.1□□□□□ -1.27
RRN9P53437 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.1□□□□□ -1.27
RRN9P53437 RRT14YIL127C 621 nt7.1□□□□□ -1.27
RRN9P53437 RHO1YPR165W 630 nt7.1□□□□□ -1.27
RRN9P53437 CKB1YGL019W 837 nt7.09□□□□□ -1.27
RRN9P53437 LSP1YPL004C 1026 nt7.09□□□□□ -1.27
RRN9P53437 SHC1YER096W 1539 nt7.09□□□□□ -1.27
RRN9P53437 CMK2YOL016C 1344 nt7.08□□□□□ -1.28
RRN9P53437 SWM1YDR260C 513 nt7.08□□□□□ -1.28
RRN9P53437 PUP3YER094C 618 nt7.08□□□□□ -1.28
RRN9P53437 AVL9YLR114C 2295 nt7.08□□□□□ -1.28
RRN9P53437 PDC5YLR134W 1692 nt7.07□□□□□ -1.28
RRN9P53437 YLR030WYLR030W 792 nt7.07□□□□□ -1.28
RRN9P53437 HXT8YJL214W 1710 nt7.07□□□□□ -1.28
RRN9P53437 TPO1YLL028W 1761 nt7.06□□□□□ -1.28
RRN9P53437 ELP6YMR312W 822 nt7.06□□□□□ -1.28
RRN9P53437 PUP1YOR157C 786 nt7.06□□□□□ -1.28
RRN9P53437 THI73YLR004C 1572 nt7.06□□□□□ -1.28
RRN9P53437 PEX28YHR150W 1740 nt7.06□□□□□ -1.28
RRN9P53437 RUP1YOR138C 2016 nt7.05□□□□□ -1.28
RRN9P53437 TES1YJR019C 1050 nt7.05□□□□□ -1.28
RRN9P53437 SAM50YNL026W 1455 nt7.04□□□□□ -1.28
RRN9P53437 YIL108WYIL108W 2091 nt7.04□□□□□ -1.28
RRN9P53437 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.04□□□□□ -1.28
RRN9P53437 CDA1YLR307W 906 nt7.04□□□□□ -1.28
RRN9P53437 ECM27YJR106W 2178 nt7.03□□□□□ -1.28
RRN9P53437 AQR1YNL065W 1761 nt7.03□□□□□ -1.28
RRN9P53437 SMC5YOL034W 3282 nt7.03□□□□□ -1.28
RRN9P53437 MTC6YHR151C 1581 nt7.03□□□□□ -1.28
RRN9P53437 POB3YML069W 1659 nt7.03□□□□□ -1.28
RRN9P53437 BAP3YDR046C 1815 nt7.02□□□□□ -1.29
RRN9P53437 YCP4YCR004C 744 nt7.02□□□□□ -1.29
RRN9P53437 YPT31YER031C 672 nt7.02□□□□□ -1.29
RRN9P53437 ATO2YNR002C 849 nt7.02□□□□□ -1.29
RRN9P53437 FCY1YPR062W 477 nt7.02□□□□□ -1.29
RRN9P53437 SNP1YIL061C 903 nt7.01□□□□□ -1.29
RRN9P53437 SLG1YOR008C 1137 nt7.01□□□□□ -1.29
RRN9P53437 MAL31YBR298C 1845 nt7.01□□□□□ -1.29
RRN9P53437 PET18YCR020C 648 nt7□□□□□ -1.29
RRN9P53437 GNA1YFL017C 480 nt7□□□□□ -1.29
RRN9P53437 YJL160CYJL160C 864 nt7□□□□□ -1.29
RRN9P53437 BXI1YNL305C 894 nt7□□□□□ -1.29
RRN9P53437 TIM50YPL063W 1431 nt7□□□□□ -1.29
RRN9P53437 YER156CYER156C 1017 nt6.99□□□□□ -1.29
RRN9P53437 HEL1YKR017C 1656 nt6.99□□□□□ -1.29
RRN9P53437 YER152W-AYER152W-A 567 nt6.98□□□□□ -1.29
RRN9P53437 PRE10YOR362C 867 nt6.98□□□□□ -1.29
RRN9P53437 YKR018CYKR018C 2178 nt6.98□□□□□ -1.29
RRN9P53437 JHD1YER051W 1479 nt6.98□□□□□ -1.29
RRN9P53437 CRN1YLR429W 1956 nt6.97□□□□□ -1.29
RRN9P53437 RPL12BYDR418W 498 nt6.97□□□□□ -1.29
RRN9P53437 MAS2YHR024C 1449 nt6.97□□□□□ -1.29
RRN9P53437 YER137CYER137C 447 nt6.96□□□□□ -1.3
RRN9P53437 SNA3YJL151C 402 nt6.96□□□□□ -1.3
RRN9P53437 YOR041CYOR041C 432 nt6.96□□□□□ -1.3
RRN9P53437 RPS6AYPL090C 711 nt6.96□□□□□ -1.3
RRN9P53437 RPS6BYBR181C 711 nt6.96□□□□□ -1.3
RRN9P53437 LEO1YOR123C 1395 nt6.95□□□□□ -1.3
RRN9P53437 YMR007WYMR007W 381 nt6.95□□□□□ -1.3
RRN9P53437 RCF2YNR018W 675 nt6.95□□□□□ -1.3
RRN9P53437 CKI1YLR133W 1749 nt6.95□□□□□ -1.3
RRN9P53437 ATP2YJR121W 1536 nt6.95□□□□□ -1.3
RRN9P53437 YBL113CYBL113C 2379 nt6.95□□□□□ -1.3
RRN9P53437 YNL040WYNL040W 1371 nt6.95□□□□□ -1.3
RRN9P53437 PRB1YEL060C 1908 nt6.94□□□□□ -1.3
RRN9P53437 PMU1YKL128C 888 nt6.94□□□□□ -1.3
RRN9P53437 MET8YBR213W 825 nt6.94□□□□□ -1.3
RRN9P53437 AOS1YPR180W 1044 nt6.92□□□□□ -1.3
RRN9P53437 HXT13YEL069C 1695 nt6.92□□□□□ -1.3
RRN9P53437 ARG7YMR062C 1326 nt6.92□□□□□ -1.3
RRN9P53437 DCR2YLR361C 1737 nt6.92□□□□□ -1.3
RRN9P53437 YPR084WYPR084W 1371 nt6.92□□□□□ -1.3
RRN9P53437 SEC24YIL109C 2781 nt6.91□□□□□ -1.3
RRN9P53437 GTS1YGL181W 1191 nt6.91□□□□□ -1.3
RRN9P53437 HAM1YJR069C 594 nt6.91□□□□□ -1.3
RRN9P53437 YMR206WYMR206W 942 nt6.91□□□□□ -1.3
RRN9P53437 BNA3YJL060W 1335 nt6.91□□□□□ -1.3
RRN9P53437 YCR061WYCR061W 1896 nt6.91□□□□□ -1.3
RRN9P53437 CDC23YHR166C 1881 nt6.91□□□□□ -1.3
RRN9P53437 TOD6YBL054W 1578 nt6.9□□□□□ -1.31
RRN9P53437 DST1YGL043W 930 nt6.89□□□□□ -1.31
RRN9P53437 SNF7YLR025W 723 nt6.89□□□□□ -1.31
RRN9P53437 ADH6YMR318C 1083 nt6.89□□□□□ -1.31
RRN9P53437 RCR1YBR005W 642 nt6.89□□□□□ -1.31
RRN9P53437 PAB1YER165W 1734 nt6.89□□□□□ -1.31
RRN9P53437 MSB3YNL293W 1902 nt6.89□□□□□ -1.31
RRN9P53437 TCB1YOR086C 3561 nt6.88□□□□□ -1.31
RRN9P53437 RMD8YFR048W 1989 nt6.88□□□□□ -1.31
RRN9P53437 UTR5YEL035C 501 nt6.88□□□□□ -1.31
RRN9P53437 YJL043WYJL043W 774 nt6.88□□□□□ -1.31
RRN9P53437 PET10YKR046C 852 nt6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.5 ms