Protein–RNA interactions for Protein: P53330

RTT102, Regulator of Ty1 transposition protein 102, yeastyeast

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTT102P53330 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.16□□□□□ -1.1
RTT102P53330 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.16□□□□□ -1.1
RTT102P53330 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.16□□□□□ -1.1
RTT102P53330 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.16□□□□□ -1.1
RTT102P53330 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.16□□□□□ -1.1
RTT102P53330 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.16□□□□□ -1.1
RTT102P53330 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.16□□□□□ -1.1
RTT102P53330 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.16□□□□□ -1.1
RTT102P53330 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.16□□□□□ -1.1
RTT102P53330 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.16□□□□□ -1.1
RTT102P53330 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.16□□□□□ -1.1
RTT102P53330 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.16□□□□□ -1.1
RTT102P53330 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.16□□□□□ -1.1
RTT102P53330 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.16□□□□□ -1.1
RTT102P53330 YML079WYML079W 606 nt8.16□□□□□ -1.1
RTT102P53330 SFP1YLR403W 2052 nt8.15□□□□□ -1.1
RTT102P53330 STE3YKL178C 1413 nt8.15□□□□□ -1.1
RTT102P53330 FTH1YBR207W 1398 nt8.15□□□□□ -1.1
RTT102P53330 ERV2YPR037C 591 nt8.15□□□□□ -1.1
RTT102P53330 YIL177CYIL177C 5277 nt8.15□□□□□ -1.11
RTT102P53330 RRP43YCR035C 1185 nt8.14□□□□□ -1.11
RTT102P53330 PUP2YGR253C 783 nt8.13□□□□□ -1.11
RTT102P53330 TES1YJR019C 1050 nt8.13□□□□□ -1.11
RTT102P53330 PIH1YHR034C 1035 nt8.12□□□□□ -1.11
RTT102P53330 YJR142WYJR142W 1029 nt8.12□□□□□ -1.11
RTT102P53330 MTC6YHR151C 1581 nt8.12□□□□□ -1.11
RTT102P53330 YNL295WYNL295W 1575 nt8.12□□□□□ -1.11
RTT102P53330 DOC1YGL240W 753 nt8.11□□□□□ -1.11
RTT102P53330 STS1YIR011C 960 nt8.11□□□□□ -1.11
RTT102P53330 ELP6YMR312W 822 nt8.11□□□□□ -1.11
RTT102P53330 KTR4YBR199W 1395 nt8.1□□□□□ -1.11
RTT102P53330 YML034C-AYML034C-A 399 nt8.1□□□□□ -1.11
RTT102P53330 ATP23YNR020C 813 nt8.1□□□□□ -1.11
RTT102P53330 NMA2YGR010W 1188 nt8.09□□□□□ -1.11
RTT102P53330 ORT1YOR130C 879 nt8.09□□□□□ -1.11
RTT102P53330 PSA1YDL055C 1086 nt8.08□□□□□ -1.12
RTT102P53330 INP54YOL065C 1155 nt8.08□□□□□ -1.12
RTT102P53330 AOS1YPR180W 1044 nt8.08□□□□□ -1.12
RTT102P53330 HAM1YJR069C 594 nt8.07□□□□□ -1.12
RTT102P53330 COS10YNR075W 1125 nt8.07□□□□□ -1.12
RTT102P53330 MIM1YOL026C 342 nt8.07□□□□□ -1.12
RTT102P53330 MSI1YBR195C 1269 nt8.07□□□□□ -1.12
RTT102P53330 HBS1YKR084C 1836 nt8.06□□□□□ -1.12
RTT102P53330 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt8.05□□□□□ -1.12
RTT102P53330 SPS1YDR523C 1473 nt8.05□□□□□ -1.12
RTT102P53330 MAS2YHR024C 1449 nt8.04□□□□□ -1.12
RTT102P53330 SLM3YDL033C 1254 nt8.04□□□□□ -1.12
RTT102P53330 YGL081WYGL081W 963 nt8.04□□□□□ -1.12
RTT102P53330 ADH6YMR318C 1083 nt8.04□□□□□ -1.12
RTT102P53330 HRB1YNL004W 1365 nt8.04□□□□□ -1.12
RTT102P53330 CDA1YLR307W 906 nt8.03□□□□□ -1.12
RTT102P53330 GTB1YDR221W 2109 nt8.03□□□□□ -1.12
RTT102P53330 YBL111CYBL111C 2004 nt8.03□□□□□ -1.12
RTT102P53330 OSM1YJR051W 1506 nt8.03□□□□□ -1.12
RTT102P53330 CDC3YLR314C 1563 nt8.02□□□□□ -1.13
RTT102P53330 UME1YPL139C 1383 nt8.02□□□□□ -1.13
RTT102P53330 YHR033WYHR033W 1272 nt8.02□□□□□ -1.13
RTT102P53330 LAT1YNL071W 1449 nt8.02□□□□□ -1.13
RTT102P53330 CKI1YLR133W 1749 nt8.01□□□□□ -1.13
RTT102P53330 YDR306CYDR306C 1437 nt8.01□□□□□ -1.13
RTT102P53330 GAL2YLR081W 1725 nt8□□□□□ -1.13
RTT102P53330 PPZ2YDR436W 2133 nt8□□□□□ -1.13
RTT102P53330 YPT10YBR264C 600 nt8□□□□□ -1.13
RTT102P53330 DUR3YHL016C 2208 nt8□□□□□ -1.13
RTT102P53330 TPO1YLL028W 1761 nt7.99□□□□□ -1.13
RTT102P53330 GET2YER083C 858 nt7.99□□□□□ -1.13
RTT102P53330 PTH2YBL057C 627 nt7.99□□□□□ -1.13
RTT102P53330 TOK1YJL093C 2076 nt7.99□□□□□ -1.13
RTT102P53330 DSC3YOR223W 879 nt7.98□□□□□ -1.13
RTT102P53330 YPC1YBR183W 951 nt7.98□□□□□ -1.13
RTT102P53330 PRY2YKR013W 990 nt7.97□□□□□ -1.13
RTT102P53330 YOX1YML027W 1158 nt7.97□□□□□ -1.13
RTT102P53330 YPQ1YOL092W 927 nt7.97□□□□□ -1.13
RTT102P53330 snR4snR4 186 nt7.97□□□□□ -1.13
RTT102P53330 CYS3YAL012W 1185 nt7.96□□□□□ -1.14
RTT102P53330 ERV25YML012W 636 nt7.96□□□□□ -1.14
RTT102P53330 YPL067CYPL067C 597 nt7.96□□□□□ -1.14
RTT102P53330 DIA4YHR011W 1341 nt7.96□□□□□ -1.14
RTT102P53330 GNP1YDR508C 1992 nt7.95□□□□□ -1.14
RTT102P53330 SKP1YDR328C 585 nt7.95□□□□□ -1.14
RTT102P53330 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.95□□□□□ -1.14
RTT102P53330 PIL1YGR086C 1020 nt7.95□□□□□ -1.14
RTT102P53330 URA1YKL216W 945 nt7.95□□□□□ -1.14
RTT102P53330 DAL80YKR034W 810 nt7.95□□□□□ -1.14
RTT102P53330 YOR072WYOR072W 315 nt7.94□□□□□ -1.14
RTT102P53330 AVL9YLR114C 2295 nt7.94□□□□□ -1.14
RTT102P53330 PEX28YHR150W 1740 nt7.93□□□□□ -1.14
RTT102P53330 YDR215CYDR215C 414 nt7.93□□□□□ -1.14
RTT102P53330 MBF1YOR298C-A 456 nt7.93□□□□□ -1.14
RTT102P53330 PET10YKR046C 852 nt7.92□□□□□ -1.14
RTT102P53330 PMT1YDL095W 2454 nt7.91□□□□□ -1.14
RTT102P53330 CKB1YGL019W 837 nt7.91□□□□□ -1.14
RTT102P53330 OPI1YHL020C 1215 nt7.91□□□□□ -1.14
RTT102P53330 CST26YBR042C 1194 nt7.91□□□□□ -1.14
RTT102P53330 BDS1YOL164W 1941 nt7.91□□□□□ -1.14
RTT102P53330 TRR2YHR106W 1029 nt7.9□□□□□ -1.14
RTT102P53330 VPS65YLR322W 315 nt7.89□□□□□ -1.15
RTT102P53330 YML122CYML122C 381 nt7.89□□□□□ -1.15
RTT102P53330 PUS7YOR243C 2031 nt7.89□□□□□ -1.15
RTT102P53330 PRS4YBL068W 981 nt7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.7 ms