Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GOLGA6L4A6NEF3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GOLGA6L4A6NEF3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GOLGA6L4A6NEF3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GOLGA6L4A6NEF3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GOLGA6L4A6NEF3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GOLGA6L4A6NEF3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GOLGA6L4A6NEF3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GOLGA6L4A6NEF3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GOLGA6L4A6NEF3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GOLGA6L4A6NEF3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GOLGA6L4A6NEF3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GOLGA6L4A6NEF3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GOLGA6L4A6NEF3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GOLGA6L4A6NEF3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
GOLGA6L4A6NEF3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
GOLGA6L4A6NEF3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GOLGA6L4A6NEF3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GOLGA6L4A6NEF3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA6L4A6NEF3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA6L4A6NEF3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA6L4A6NEF3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA6L4A6NEF3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA6L4A6NEF3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLGA6L4A6NEF3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLGA6L4A6NEF3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLGA6L4A6NEF3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GOLGA6L4A6NEF3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GOLGA6L4A6NEF3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GOLGA6L4A6NEF3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GOLGA6L4A6NEF3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GOLGA6L4A6NEF3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA6L4A6NEF3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA6L4A6NEF3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA6L4A6NEF3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA6L4A6NEF3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLGA6L4A6NEF3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLGA6L4A6NEF3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLGA6L4A6NEF3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLGA6L4A6NEF3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLGA6L4A6NEF3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GOLGA6L4A6NEF3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GOLGA6L4A6NEF3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GOLGA6L4A6NEF3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GOLGA6L4A6NEF3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA6L4A6NEF3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA6L4A6NEF3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA6L4A6NEF3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA6L4A6NEF3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA6L4A6NEF3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA6L4A6NEF3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA6L4A6NEF3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA6L4A6NEF3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA6L4A6NEF3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA6L4A6NEF3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA6L4A6NEF3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA6L4A6NEF3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA6L4A6NEF3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GOLGA6L4A6NEF3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GOLGA6L4A6NEF3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GOLGA6L4A6NEF3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GOLGA6L4A6NEF3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GOLGA6L4A6NEF3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GOLGA6L4A6NEF3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GOLGA6L4A6NEF3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GOLGA6L4A6NEF3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GOLGA6L4A6NEF3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GOLGA6L4A6NEF3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GOLGA6L4A6NEF3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GOLGA6L4A6NEF3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GOLGA6L4A6NEF3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GOLGA6L4A6NEF3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GOLGA6L4A6NEF3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GOLGA6L4A6NEF3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GOLGA6L4A6NEF3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLGA6L4A6NEF3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLGA6L4A6NEF3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GOLGA6L4A6NEF3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GOLGA6L4A6NEF3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GOLGA6L4A6NEF3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA6L4A6NEF3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA6L4A6NEF3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA6L4A6NEF3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA6L4A6NEF3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA6L4A6NEF3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA6L4A6NEF3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA6L4A6NEF3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA6L4A6NEF3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA6L4A6NEF3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA6L4A6NEF3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA6L4A6NEF3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA6L4A6NEF3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA6L4A6NEF3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GOLGA6L4A6NEF3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms