Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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PTPN13Q12923 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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PTPN13Q12923 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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PTPN13Q12923 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
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PTPN13Q12923 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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PTPN13Q12923 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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PTPN13Q12923 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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