Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRTO14522 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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