Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC30■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms