Protein–RNA interactions for Protein: Q9P107

GMIP, GEM-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMIPQ9P107 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms