Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NECAP2Q9NVZ3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms