Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ3

NLGN4Y, Neuroligin-4, Y-linked, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4YQ8NFZ3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLGN4YQ8NFZ3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms