Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2E1P29083 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms