Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NECAP2Q9NVZ3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms